MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid cp32-9

Total Repeats: 95

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017228	TAT	2	6	30	35	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017228	AC	3	6	36	41	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017228	TAA	2	6	46	51	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017228	AGG	2	6	3354	3359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017228	AGG	2	6	3948	3953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017228	TA	3	6	11912	11917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017228	AT	3	6	11966	11971	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017228	TAC	2	6	12011	12016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017228	TCAA	2	8	12018	12025	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017228	AATTT	2	10	12112	12121	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017228	TAG	2	6	12147	12152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017228	CCAA	2	8	12164	12171	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017228	ATT	2	6	14104	14109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017228	AAT	2	6	14134	14139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017228	AGG	2	6	14175	14180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017228	T	6	6	15003	15008	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017228	TA	3	6	15029	15034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017228	TA	3	6	15038	15043	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017228	A	6	6	15049	15054	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017228	T	6	6	15224	15229	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017228	GGAAAT	2	12	15236	15247	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017228	A	6	6	15257	15262	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017228	AAG	2	6	15682	15687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017228	AGA	2	6	15704	15709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017228	CTT	2	6	15711	15716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017228	AG	3	6	15717	15722	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017228	TCC	2	6	17031	17036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_017228	TAAA	2	8	17047	17054	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017228	TA	3	6	17055	17060	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017228	T	6	6	17082	17087	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017228	A	7	7	17102	17108	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017228	ATTAA	2	10	17285	17294	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017228	TAA	2	6	17301	17306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017228	TAA	2	6	17315	17320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017228	T	7	7	17321	17327	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017228	TTA	3	9	17371	17379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017228	TAA	2	6	17382	17387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017228	A	6	6	17399	17404	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017228	AGG	2	6	19851	19856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017228	A	6	6	20958	20963	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017228	T	6	6	20976	20981	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017228	TAT	2	6	20986	20991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017228	TGA	2	6	21002	21007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017228	A	6	6	21016	21021	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017228	ATTTT	2	10	21026	21035	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017228	AGTG	2	8	21247	21254	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017228	TAG	2	6	21271	21276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017228	T	7	7	21297	21303	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017228	T	6	6	21310	21315	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017228	ATA	2	6	21348	21353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017228	AT	3	6	21383	21388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017228	TGG	2	6	21407	21412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017228	T	7	7	21455	21461	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017228	A	6	6	21487	21492	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017228	TA	4	8	21507	21514	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017228	AT	3	6	21518	21523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017228	A	9	9	21527	21535	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017228	TAT	2	6	21541	21546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017228	T	10	10	21611	21620	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017228	A	6	6	21635	21640	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017228	TTAT	4	16	21661	21676	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017228	A	6	6	23036	23041	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017228	A	7	7	23044	23050	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017228	A	6	6	23071	23076	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017228	TTA	2	6	23080	23085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017228	AAAAC	2	10	23093	23102	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_017228	T	6	6	23144	23149	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017228	AAGTAA	2	12	24317	24328	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017228	AT	3	6	24334	24339	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017228	CAAAAA	2	12	24363	24374	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_017228	AAGA	2	8	24471	24478	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017228	AT	3	6	24495	24500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017228	ATTTG	2	10	24516	24525	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017228	GA	3	6	24570	24575	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017228	A	8	8	24658	24665	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017228	GCATT	2	10	24679	24688	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_017228	GA	3	6	25279	25284	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017228	TAA	2	6	25953	25958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017228	ATA	2	6	26002	26007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017228	AGG	2	6	26013	26018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017228	TTTAAA	2	12	26535	26546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017228	TAA	2	6	26558	26563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017228	TATT	2	8	26564	26571	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017228	AGA	2	6	26584	26589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017228	AAAAT	2	10	26594	26603	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017228	TTG	2	6	26654	26659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017228	TA	3	6	27398	27403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017228	TAA	3	9	27424	27432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017228	CAG	2	6	27450	27455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017228	AAT	2	6	27468	27473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017228	TAA	2	6	27488	27493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017228	TTA	2	6	27495	27500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017228	TAT	2	6	27509	27514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017228	TAA	2	6	27521	27526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017228	AAG	2	6	28051	28056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.